Пополнить ФНЛ может представитель кубанского футбола — команда «Краснодар-2». Клуб ответил согласием на официальное предложение ФНЛ. В новом сезоне «Краснодар-2» заменит «Анжи» из Махачкалы, который остался в Премьер-Лиге в связи с отзывом лицензии РФС у пермского «Амкара».
По регламентным требованиям на место в ФНЛ могли претендовать два клуба ПФЛ - «Локомотив-Казанка» (третье место в группе «Запад») и «Краснодар-2» (четвёртое место в группе «Юг»). Фармклуб московского «Локомотива» заявил о неготовности пока играть в первом дивизионе, а решение о включении «Краснодара-2» в состав участников первенства ФНЛ-2018/19 будет принято общим собранием ФНЛ в ближайшее время.